एन्टिफंगल एजेन्ट व सामान्य आहारया एडिटिभ प्रोपियोनिक एसिड (पीपीए) ग्यास्ट्रोइन्टेस्टाइनल डिसफंक्सन नापं मुस्याय् असामान्य न्युरोडेभलपमेन्ट जुइगु क्यनातःगु दु, गुगु आन्द्रा डिस्बायोसिसया कारणं जुइफु । आहारया पीपीए एक्सपोजर व आन्द्रा माइक्रोबायोटा डिस्बायोसिस दथुइ स्वापू दूगु सुझाव बियातःगु दु, तर प्रत्यक्ष अनुसन्धान मजूनि। थन, जिमिसं आन्द्रा माइक्रोबायोटा संरचनाय् पीपीए-नाप स्वापू दूगु हिउपाया अनुसन्धान याना गुकिलिं डिस्बायोसिस जुइफु। उपचार मयाःगु आहार (n=9) व पीपीए-समृद्ध आहार (n=13) नकूपिं मुस्याया आन्द्रा माइक्रोबायोमयात माइक्रोबियल संरचना व ब्याक्टेरियाया मेटाबोलिक लँपुइ अन्तरया मूल्यांकन यायेत ताःहाकःगु दूरीया मेटाजेनोमिक अनुक्रमण छ्यला अनुक्रमण याःगु खः । आहारया पीपीए महत्त्वपूर्ण ट्याक्साया प्रचुरता अप्वइगुलिं स्वापू दूगु खने दु, गुकिलि यक्व ब्याक्टेरोइड्स, प्रिभोटेला, व रुमिनोकोकस प्रजाति ला, गुकिया दुजःत थ्व स्वया न्ह्यः पीपीए उत्पादनय् दुथ्यानाच्वंगु दु। पीपीए-एक्सपोजर जूगु मुस्याया माइक्रोबायोमय् नं लिपिड मेटाबोलिज्म व स्टेरोइड हार्मोन बायोसिन्थेसिसलिसे स्वापू दूगु लँपु अप्वः दयाच्वंगु खः । जिमिगु लिच्वलं पिपिएं आन्द्राया माइक्रोबायोटा व उकिया लिसे स्वापू दुगु मेटाबोलिक लँपुइ हिउपाः हयेफु धकाः संकेत याइ । थ्व अवलोकित हिउपां खपतया निंतिं सुरक्षित कथं वर्गीकृत परिरक्षकं आन्द्रा माइक्रोबायोटाया संरचना व, लिपा, मनुया स्वास्थ्ययात प्रभावित यायेफु धकाः उजागर याइ।
मनुया माइक्रोबायोमयात प्रायः “शरीरया लिपांगु अंग” धकाः धाइ व मनुया स्वास्थ्यय् महत्वपूर्ण भूमिका म्हिती (बाक्वेरो व नोम्बेला, २०१२)। विशेष यानाः, आन्द्रा माइक्रोबायोमयात थःगु सिस्टम-व्यापी प्रभाव व यक्व आवश्यक ज्याय् भूमिकाया निंतिं मान्यता बियातःगु दु। कमेन्सल ब्याक्टेरिया आन्द्राय् यक्व दयाच्वनि, गुकिलिं यक्व पारिस्थितिक थाय् कब्जा याइ, पोषक तत्त्वया छ्येला याइ, व सम्भावित रोगजनकनाप प्रतिस्पर्धा याइ (जन्ध्याला व मेमेपिं, २०१५)। आन्द्रा माइक्रोबायोटाया विविध ब्याक्टेरियाया घटकं भिटामिन थें न्याःगु आवश्यक पोषक तत्व उत्पादन यायेत व पाचनयात प्रोत्साहन बीत सक्षम जुइ (रोल्याण्ड एट अल, २०१८)। ब्याक्टेरियाया मेटाबोलाइटं नं टिसु विकासयात प्रभावित याइगु व मेटाबोलिक व प्रतिरक्षा लँपुयात अप्वयेकीगु क्यनातःगु दु (हेइजत्ज एट अल, २०११; यु एट अल, २०२२)। मनुया आन्द्रा माइक्रोबायोमया संरचना अत्यन्त विविध जुइ व थ्व आहार, लिंग, वासः, व स्वास्थ्य अवस्था थें न्याःगु आनुवंशिक व वातावरणीय कारकय् निर्भर जुइ (कुम्भरे व मेमेपिं, २०१९)।
मातृ आहार भ्रूण व नवजात विकासया छगू महत्वपूर्ण घटक ख व विकासयात प्रभावित यायेफुगु यौगिकया छगू पुटेटिभ स्रोत ख (बेजर एट अल, २००४; इनिस, २०१४)। थन्यागु छगू ब्याजया यौगिक प्रोपिओनिक एसिड (पीपीए) ख, गुगु ब्याक्टेरियाया किण्वनं प्राप्त जुइगु छगू शर्ट-चेन फ्याटी एसिड उपोत्पाद व छगू खाद्य योजक ख (डेन बेस्टेन एट अल, २०१३)। पीपीएय् एन्टिब्याक्टेरियल व एन्टिफंगल गुण दुगुलिं थुकियात खाद्य परिरक्षकया रुपय् व औद्योगिक छ्येलेज्याय् फोहर व ब्याक्टेरियाया वृद्धियात पनेगु निंतिं छ्येलिगु या (Wemmenhove et al., 2016)। पिपिएया थी थी टिस्यूइ थी थी प्रभाव लाइ । लिभरय् पीपीएया म्याक्रोफेजय् साइटोकाइन अभिव्यक्तियात प्रभावित याना एन्टि इन्फ्लेमेटरी प्रभाव जुइ (कावासो एट अल, २०२२)। थ्व नियामक प्रभाव मेमेगु प्रतिरक्षा कोषय् नं खने दु, गुकिलिं इन्फ्लेमेसनया डाउनरेगुलेसन जुइ (हासे एट अल, २०२१)। न्ह्याथेसां, न्ह्यपुइ उल्टा प्रभाव खनेदूगु दु । थ्व स्वया न्ह्यःया अध्ययनं क्यंगु दु कि पीपीए एक्सपोजरं मुस्याय् अटिजम थें न्याःगु व्यवहार ब्वलंकी (एल-अन्सरी एट अल, २०१२)। मेमेगु अध्ययनं क्यंगु दु कि पीपीए नं ग्लियोसिसयात प्रेरित यायेफु व मस्तिष्कय् प्रो-इन्फ्लेमेटरी लँपुयात सक्रिय यायेफु (अब्देली एट अल, २०१९)। पीपीए छगू कमजोर एसिड जूगुलिं थ्व आन्द्राया एपिथेलियम जुया हिइ प्रसार जुइफु व थन्यागु कथं हि-मस्तिष्कया बाधा नापं प्लेसेन्टा नापंया प्रतिबन्धात्मक बाधायात पार यायेफु (स्टिनसन एट अल, २०१९), गुकिलिं ब्याक्टेरियां उत्पादन याइगु नियामक मेटाबोलाइटया रुपय् पीपीएया महत्त्वयात उजागर याइ। अटिजमया निंतिं जोखिम कारकया रुपय् पीपीएया सम्भावित भूमिका थौंकन्हय् अनुसन्धानया चरणय् दुसां अटिजम दुपिं व्यक्तिइ थुकिया प्रभाव न्युरल डिफ्रेन्सिएसनयात प्रेरित यायेगु स्वया नं अप्व जुइफु।
न्यूरोडेभलपमेन्टल डिसअर्डर दुपिं ल्वगितेगु ग्यास्ट्रोइन्टेस्टाइनल लक्षण गथेकि झारा व कब्जियत सामान्य खने दु (काओ एट अल, २०२१)। थ्व स्वया न्ह्यःया अध्ययनं क्यंगु दु कि अटिज्म स्पेक्ट्रम डिसअर्डर (एएसडी) दुपिं ल्वगितेगु माइक्रोबायोम स्वस्थ व्यक्ति स्वया फरक जुइ, गुकिलिं आन्द्रा माइक्रोबायोटा डिस्बायोसिसया उपस्थितिया सुझाव बी (फाइनगोल्ड एट अल, २०१०)। अथे हे, भडकाऊ मलद्वार ल्वे, मोटोपन, अल्जाइमर ल्वे आदि ल्वगितेगु माइक्रोबायोम विशेषता नं स्वस्थ व्यक्ति स्वया फरक जुइ (टर्नबाउ व मेमेपिं, २००९; भोग्ट व मेमेपिं, २०१७; हेन्के व मेमेपिं, २०१९)। तर थौं तक्क आन्द्रा माइक्रोबायोम व न्यूरोलोजिकल ल्वे वा लक्षण दथुइ छुं नं कारण सम्बन्ध स्थापित मजूनि (याप एट अल, २०२१), यद्यपि थ्व ल्वेया छुं अवस्थाय् यक्व ब्याक्टेरिया प्रजातिं भूमिका म्हितीगु खने दु। दसुया निंतिं, अटिजमया ल्वगितेगु माइक्रोबायोटाय् अकेरमान्सिया, ब्याक्टेरोइड्स, क्लोस्ट्रिडियम, ल्याक्टोबेसिलस, डेसल्फोभिब्रियो व मेमेगु जेनेरा अप्व दु (टोमोभा व मेमेपिं, २०१५; गोलुबेभा व मेमेपिं, २०१७; क्रिस्टियानो व मेमेपिं, २०१८, जुरिता२०)। उल्लेखनीय कथं, थ्व छुं जेनेराया सदस्य प्रजातिइ पीपीए उत्पादननाप स्वापू दूगु जीन दूगु खने दु (राइचार्ड व मेमेपिं, २०१४; युन व ली, २०१६; झाङ व मेमेपिं, २०१९; बाउर व डुरे, २०२३)। पीपीएया एन्टिमाइक्रोबियल गुणयात स्वया थुकिया प्रचुरता अप्वयेकेगु पीपीए उत्पादक ब्याक्टेरियाया वृद्धिया निंतिं फाइदाजनक जुइफु (जेकबसन एट अल, २०१८)। थुकथं, पीएफए-समृद्ध वातावरणं ग्यास्ट्रोइन्टेस्टाइनल प्याथोजेन नापं आन्द्रा माइक्रोबायोटाय् हिउपा हयेफु, गुकिलिं ग्यास्ट्रोइन्टेस्टाइनल लक्षणया सम्भावित कारक जुइफु।
माइक्रोबायोम अनुसन्धानय् छगू केन्द्रिय न्ह्यसः थ्व ख कि माइक्रोबियल संरचनाय् भिन्नता अन्तर्निहित ल्वेया कारण वा लक्षण ख। आहार, आन्द्रा माइक्रोबायोम व न्यूरोलोजिकल ल्वे दथुइ जटिल स्वापूयात स्पष्ट यायेगु न्हापांगु पलाः धइगु माइक्रोबियल संरचनाय् आहारया प्रभावया मूल्यांकन यायेगु खः । थुकिया निंतिं जिमिसं पीपीए-समृद्ध वा पीपीए-कम आहार नकूपिं मुस्याया सन्तानया आन्द्रा माइक्रोबायोमया तुलना यायेत ताःहाकःगु ब्वनेगु मेटाजेनोमिक सिक्वेन्सिङ छ्यलागु खः । सन्तानयात इमि मांयात थें हे नसा नकल । जिमिसं थ्व परिकल्पना याना कि पीपीए-समृद्ध आहारया लिच्वः कथं आन्द्रा माइक्रोबियल संरचना व माइक्रोबियल क्रियाशील लँपुइ हिउपाः वइ, विशेष यानाः पीपीए मेटाबोलिज्म व/वा पीपीए उत्पादनलिसे स्वापू दूगु।
थुगु अध्ययनय् एफभीबी/एन-टिजी(जीएफएपी-जीएफपी)१४मेस/जे ट्रान्सजेनिक मुस्यात (ज्याक्सन प्रयोगशाला) छ्यःगु खः गुकिं ग्लिया-विशिष्ट जीएफएपी प्रोमोटरया नियन्त्रणय् ग्रीन फ्लोरोसेन्ट प्रोटिन (जीएफपी)यात ओभरएक्सप्रेस याइ, गुकिं केन्द्रीय फ्लोरिडा विश्वविद्यालयया केन्द्रीय फ्लोरिडा संस्थागत पशु हेरचाह व प्रयोग समिति ( NuCFU- Use Committee: प्रोटो२०२०००००२)। दुरु त्वंकेधुंका मुस्यात व्यक्तिगत रुपं पन्जलय् तया छगू पन्जलय् प्रत्येक लिंगया १–५ म्ह मुस्यात तया तःगु ख। मुस्यायात शुद्धिकरण नियन्त्रण आहार (परिमार्जित खुल्ला लेबल स्ट्यान्डर्ड डाइट, १६ केकेएल% चिकं) वा सोडियम प्रोपिओनेट-पूरक आहार (परिमार्जित खुल्ला लेबल स्ट्यान्डर्ड आहार, १६ केकेएल% चिकं, ५,००० पीपीएम सोडियम प्रोपिओनेट दूगु) एड लिबिटम नकेगु यात। छ्यःगु सोडियम प्रोपिओनेटया मात्रा ५,००० एमजि पिएफए/केजि मुक्कं नसा तौल बराबर खः । थ्व खाद्य परिरक्षकया रुपय् छ्यलेत स्वीकृत जूगु पीपीएया दकलय् अप्वः मात्रा खः । थ्व अध्ययनया निंतिं तयारी यायेत अभिभावक मुस्यायात संभोग जुइ न्ह्यः ४ वाःतक निगुलिं आहार बियाः ड्यामया गर्भावस्थाया दक्वं ई तक निरन्तरता बिउगु खः । सन्तान मुस्या [२२ मुस्या, ९ नियन्त्रण (६ मिजं, ३ मिसा) व १३ पीपीए (४ मिजं, ९ मिसा)]यात दुरु त्वंकेगु व अनंलि ५ महिना तक ड्यामया थें हे आहारय् निरन्तरता बीगु ज्या जुल। सन्तान मुस्यायात ५ महिना दुबलय् बलिदान यानाः इमिगु आन्द्राया मलमूत्रया सामग्री मुंकाः न्हापा १.५ एमएल माइक्रोसेन्ट्रिफ्युज ट्युबय् -२०° सेल्सियसय् भण्डारण यानाः -८०° सेल्सियसय् फ्रिजय् तयाः होस्ट डीएनए क्वचायेकाः माइक्रोबियल न्यूक्लिक एसिड पिकायेगु ज्या याःगु खः ।
छगू परिमार्जित प्रोटोकल कथं होस्ट डिएनए लिकयाबिल (चारालाम्पस एट अल, २०१९)। संक्षेपय्, मलमूत्रया सामग्री ५०० μl इन्हिबिटएक्स (कियाजेन, क्याट#/आइडी: १९५९३)य् स्थानान्तरण याना फ्रिजय् भण्डारण यानातःगु ख। छगू निष्कर्षणय् अप्वलय् १-२ मल पेलेट प्रशोधन या । अनंलि मलमूत्रया सामग्रीयात ट्यूब दुने प्लाष्टिकया पेस्टल छ्यला यान्त्रिक रुपं होमोजेनाइज यानाः स्लरी दयेकूगु खः । नमूनायात १०,००० आरसीएफय् ५ मिनेट वा नमूना पेलेट मजूतले सेन्ट्रिफ्युज यानादिसँ, अनंलि सुपरनेतेन्तयात एस्पिरेट यानादिसँ व पेलेटयात २५० μl १× पीबीएसय् रिसस्पेन्ड यानादिसँ। युकेरियोटिक कोष झिल्लीयात ढीला यायेत डिटर्जेन्टया रुपय् नमूनाय् २५० μl ४.४% सापोनिन द्रावण (TCI, उत्पादन ल्याः S0019) तयादिसँ। नमूनायात बुलुहुं ल्वाकछ्यानाः १० मिनेटया निंतिं क्वथाया तापक्रमय् इन्क्यूबेट यात । थ्व धुंका युकेरियोटिक कोषयात बाधित यायेत नमूनाय् ३५० μl न्युक्लिज मुक्त लः तया ३० s तक्क इन्क्युबेट याना १२ μl ५ M NaCl तया। अनंलि नमूनायात ६००० आरसिएफय् ५ मिनेटया निंतिं सेन्ट्रिफ्यूज यात । सुपरनेटेन्तयात एस्पिरेट यानाः १०० μl १X PBS य् पेलेटयात हानं सस्पेन्ड यानादिसँ । होस्ट डीएनए लिकायेत १०० μl एचएल-एसएएन बफर (१२.८५६८ g NaCl, ४ ml १M MgCl2, ३६ ml न्यूक्लिज-मुक्त लः) व १० μl एचएल-एसएएन एन्जाइम (आर्टिकजाइम्स P/N ७०९१०-२०२) तयादिसँ। नमूनायात पिपेट यानाः बांलाक मिक्स यानाः ३७ °C य् ३० मिनेटया निंतिं ८०० rpm य् EppendorfTM ThermoMixer C य् इन्क्यूबेट यानाः ३ मिनेटया निंतिं ६००० RCF य् सेन्ट्रिफ्युज यानाः ८०० μ0μl व P01μl व P010m य् निक्वः धुनाबिल । लिपतय्, १०० μl १X PBS य् पेलेटयात हानं सस्पेन्ड या ।
न्यू इंग्ल्याण्ड बायोल्याब्स मोनार्क जेनोमिक डीएनए प्युरिफिकेशन किट (न्यु इंग्ल्याण्ड बायोल्याब्स, इप्सविच, एमए, क्याट# टी३०१०एल) छ्यला कुल ब्याक्टेरियाया डीएनए अलग याःगु खः । किटलिसें बियातःगु स्टान्डर्ड अपरेटिङ्ग प्रक्रिया भचा हिलातःगु दु । अन्तिम इलुसनया निंतिं अपरेशन याये न्ह्यः न्यूक्लिज मदुगु लःयात ६० डिग्री सेल्सियसय् इन्क्यूबेट यानाः मर्मत यानादिसँ । प्रत्येक नमूनाय् १० माइक्रोलिटर प्रोटिनेज के व ३ माइक्रोलिटर आरएनएज ए तनादिसँ । अले १०० μl सेल लाइसिस बफर ति अले बुलुहुं ल्वाकछ्या । अनंलि नमूनायात एपेन्डोर्फ TM थर्मोमिक्सर सीइ ५६° सेल्सियस व १४०० आरपीएमय् म्होतिं नं १ घण्टा व ३ घण्टा तक्क इन्क्यूबेट यानातःगु ख। इन्क्युबेट यानातःगु नमूनायात १२,००० आरसीएफय् ३ मिनेटया निंतिं सेन्ट्रिफ्युज यानाः प्रत्येक नमूनाया सुपरनेटेन्तयात ४०० μL बाइन्डिङ सोलुसन दूगु ब्यागलं १.५ एमएल माइक्रोसेन्ट्रिफ्युज ट्युबय् स्थानान्तरण याःगु खः । अनंलि ट्युबयात १ सेकेण्डया अन्तरालय् ५–१० सेकेण्डया निंतिं पल्स भर्टेक्स यानातःगु ख। प्रत्येक नमूनाया मुक्कं तरल पदार्थ (लगभग ६००–७०० μL)यात फ्लो-थ्रू कलेक्सन ट्युबय् तयातःगु फिल्टर कार्ट्रिजय् स्थानान्तरण या। ट्युबयात १,००० आरसीएफय् ३ मिनेटया निंतिं सेन्ट्रिफ्युज याना प्रारम्भिक डीएनए बाइन्डिङ यायेत अनुमति बिल व अनंलि १२,००० आरसीएफय् १ मिनेटया निंतिं सेन्ट्रिफ्युज याना अवशिष्ट तरल पदार्थ लिकायेगु ज्या जुल। नमूना कोलुमयात न्हूगु संकलन ट्यूबय् स्थानान्तरण यात अले निक्वः सिलाबिल । न्हापां सिलेगु निंतिं, प्रत्येक ट्यूबय् ५०० माइक्रोलिटर सिलेगु बफर तनादिसँ । ट्युबयात ३–५ क्वः उल्टे यानाः १२,००० आरसीएफय् १ मिनेटया निंतिं सेन्ट्रिफ्युज यानादिसँ । संकलन ट्यूबं तरल पदार्थ वांछ्वयादिसँ अले फिल्टर कार्ट्रिजयात हाकनं व हे संकलन ट्यूबय् तयादिसँ । निक्वःगु वाशया निंतिं, इन्भर्ट मयासे फिल्टरय् ५०० μL वाश बफर तयादिसँ । १२,००० आरसिएफय् १ मिनेटया निंतिं नमूनायात सेन्ट्रिफ्यूज यात । फिल्टरयात १.५ एमएल लोबिन्ड® ट्युबय् स्थानान्तरण यानाः १०० μएल प्रि-वार्म न्यूक्लिज मुक्त लः तयादिसँ । फिल्टरयात कोथाया तापक्रमय् १ मिनेट इन्क्यूबेट यानाः १२,००० आरसीएफय् १ मिनेट सेन्ट्रिफ्युज यानाः । इल्युटेड डिएनएयात -८० डिग्री सेल्सियसय् भण्डारण यानातःगु खः ।
क्यूबिट टिएम ४.० फ्लोरोमिटर छ्यलाः डिएनए कन्सन्ट्रेसनया परिमाणन याःगु खः । निर्माताया निर्देशन कथं क्यूबिट TM १एक्स डीएसडीएनए हाई सेन्सिटिभिटी किट (Cat. No. Q33231) छ्यला डीएनए तयार याःगु खः । डिएनए टुक्राया हाकः वितरण एग्लिएन्ट टिएम ४१५० बाय् ४२०० टेपस्टेशन छ्यला मापन याःगु खः । एजिलेन्ट टीएम जेनोमिक डीएनए रिएजेन्ट्स (कैट ल्याः ५०६७–५३६६) व जेनोमिक डीएनए स्क्रीनटेप (कैट ल्याः ५०६७–५३६५) छ्यला डीएनए तयार याःगु खः । लाइब्रेरी तयारी निर्माताया निर्देशन कथं अक्सफोर्ड नैनोपोर टेक्नोलोजीज TM (ओएनटी) रैपिड पीसीआर बारकोडिङ किट (एसक्यूके-आरपीबी००४) छ्यला याःगु खः । डीएनएयात मिन१०६डी फ्लो सेल (आर ९.४.१) दूगु ओएनटी ग्रिडआइओएनटीएम एमके१ सिक्वेन्सर छ्यला सिक्वेन्स याःगु ख। अनुक्रमण सेटिङत: उच्च सटीकता बेस कलिंग, ९ या न्यूनतम q भ्यालु, बारकोड सेटअप, व बारकोड ट्रिम। ७२ घण्टाया निंतिं नमूनाया अनुक्रमण याःगु खः, गुकिया लिपा बेस कल डाटायात थप प्रशोधन व विश्लेषणया निंतिं बुझे याःगु खः ।
बायोइन्फर्मेटिक्स प्रशोधन न्हापा वर्णन यानातःगु विधि छ्यला याःगु ख (ग्रीनम्यान एट अल, २०२४)। सिक्वेन्सिङ्गपाखें वःगु फास्टक्यू फाइलयात प्रत्येक नमूनाया निंतिं डाइरेक्टरिइ ब्वथलातःगु खः । बायोइन्फर्मेटिक्स विश्लेषण याये न्ह्यः तथ्यांकयात थुकथंया पाइपलाइन छ्यला प्रोसेस याःगु खः : न्हापां नमूनाया फास्टक्यू फाइलयात छगू हे फास्टक्यू फाइलय् मर्ज याःगु खः । अनंलि, १००० बीपी स्वया चिधंगु रीडयात फिल्टलोङ v.०.२.१ छ्यला फिल्टर याःगु ख, गुकिलि छगू जक्क प्यारामिटर हिलाबिल –min_length १००० (विक, २०२४)। थप फिल्टर याये न्ह्यः, ब्वनेगु गुणस्तरयात नानोप्लट v. १.४१.३ छ्यला क्वय् बियातःगु प्यारामिटरलिसे नियन्त्रण याःगु खः : –fastq –plots dot –N50 -o(डी कोस्टर व रेडमेकर्स, २०२३)। रीडयात माउस रेफरेन्स जीनोम GRCm39 (GCF_000001635.27) नापं मिनिम्याप२ v.(ली, २०१८) । उत्पन्न संरेखण फाइलयात सैमटुल्स v. १.१६.१ य् सैमटुल्स भ्यू -बी (डेनसेक एट अल, २०२१) छ्यला बीएएम फर्म्याटय् हिलाबिल। अनंलि samtools view -b -f 4 छ्येला अनलाइन रिडया पहिचान याःगु ख, गुकिलिं थ्व रिड होस्ट जीनोमया मखु धकाः संकेत बिल। डिफल्ट प्यारामिटर दुगु samtools bam2fq छ्यला अनलाइन रीडयात हानं FASTQ फर्म्याटय् हिलाबिल । न्हापा वर्णन यानातःगु सेटिङ्ग छ्यलाः मेगु फिल्टर यानातःगु रीडय् नानोप्लटयात हाकनं चले याःगु खः । फिल्टर यायेधुंकाः, मेटाजेनोमिक डाटायात मेटाफ्लाइ भि. २.८.२-बि१६८९ छ्यलाः क्वय् बियातःगु प्यारामिटर नापं मुंकल : –नानो-कच्चा–मेटा (कोल्मोगोरोभ व अन्य, २०२०)। ल्यं दुगु प्यारामिटरयात इमिगु डिफल्ट भ्यालुइ त्वःति । एसेम्बली धुंका फिल्टर यानातःगु रिडयात minimap2 छ्येला एसेम्बलीइ म्याप यानातःगु ख, व -ax map-ont प्यारामिटर छ्येला SAM फर्म्याटय् एलाइन्मेन्ट फाइल दयेकल। सभायात दकलय् न्हापां रेकन v. १.४.२० छ्यला थुकथंया मापदण्ड नापं परिष्कृत याःगु ख: -m ८ -x -६ -g -८ -w ५०० -u ( Vaser et al., 2017 ). रेकन क्वचायेधुंका मेडाका v. १.७.२ नाप अझ परिष्कृत जुल, medaka_consesus छ्येला, -m प्यारामिटर बाहेक फुक्क प्यारामिटरयात थःगु पूर्वनिर्धारित मूल्यय् त्वःताबिल। -m प्यारामिटर r941_min_hac_g507 य् सेट यानातःगु दु गुकिलिं झीगु डाटाया निंतिं छ्यलिगु फ्लो सेल केमेस्ट्री व उच्च-सटीकता बेस कलिंग निर्दिष्ट याइ (नानोपोरेटेक/मेदाका, २०२४)। फिल्टर यानातःगु तथ्यांक (थ्व धुंका माइक्रोबियल तथ्यांक धाइ) व अन्तिम सफा यानातःगु एसेम्बलीयात लिपाया विश्लेषणया निंतिं छ्येलातःगु ख।
टैक्सोनोमिक वर्गीकरणया निंतिं, रीड व एसेम्बल कन्टिगयात क्राकेन२ v. २.१.२ ( वुड एट अल, २०१९ ) छ्येला वर्गीकृत याःगु ख। क्रमशः ब्वनेगु व मुंकेगु निंतिं रिपोर्ट व आउटपुट फाइल दयेकि । ब्वनेगु व एसेम्बलि विश्लेषण यायेत –use-names विकल्प छ्यलादिसँ । –gzip-कम्प्रेस्ड व –पेयर विकल्पत ब्वनेगु खण्डया निंतिं निर्दिष्ट यानातःगु दु । मेटाजेनोमय् ट्याक्साया सापेक्षिक प्रचुरता ब्राकेन v. २.८ ( Lu et al., 2017 ) छ्यला अनुमानित याःगु ख। जिमिसं न्हापां क्वय् बियातःगु प्यारामिटर दुगु ब्राकेन-बिल्ड छ्यलाः १००० बेस दुगु केएमआर डाटाबेस दयेका : -डि-k ३५ -l १००० छक्वः दयेकेधुंकाः, ब्राकेन क्राकेन२ पाखें पिकाःगु रिपोर्टया लिधंसाय् चले जुइ अले क्वय् बियातःगु विकल्प छ्यलाः डाटा फिल्टर याइ : -d -I -O-पि १००० -एल

उकी मध्ये, विश्लेषण यानाच्वंगु वर्गिकरण तहया आधारय् पि, जि बाय् एस ल्यइ । मिथ्या सकारात्मक वर्गीकरणया प्रभावयात म्हो यायेत १e-४ (१/१०,००० रीड)या न्यूनतम सापेक्षिक प्रचुरता थ्रेसहोल्डयात नालाकाःगु ख। तथ्यांकीय विश्लेषण स्वया न्ह्यः ब्राकेनं रिपोर्ट याःगु सापेक्षिक प्रचुरता (fraction_total_reads) केन्द्रित लग-अनुपात (CLR) रुपान्तरण छ्येला रुपान्तरण याःगु ख (Aitchison, 1982)। डाटा रुपान्तरणया निंतिं सीएलआर विधि ल्यःगु खः छाय् धाःसा थ्व स्केल-इन्भेरिएन्त व गैर-विरल डाटासेटया निंतिं पर्याप्त जुइ (ग्लोर एट अल, २०१७)। सिएलआर रुपान्तरणं प्राकृतिक लघुगणक छ्यली । ब्राकेनं रिपोर्ट याःगु ल्याःचाःया तथ्यांकयात सापेक्षिक लग अभिव्यक्ति (आरएलई) छ्यला सामान्यीकरण याःगु खः (एन्डर्स व ह्युबर, २०१०) । म्याटप्लटलिब v. ३.७.१, सीबोर्न v. ३.७.२ व क्रमिक लघुगणक (ग्लोर एट अल, २०१७)या संयोजन छ्यला चित्र दयेकूगु खः । ०.१२.२ व स्ट्यान्टानोटेशन्स v. ०.५.० (हन्टर, २००७; वास्कम, २०२१; चार्लियर एट अल, २०२२)। सामान्यीकृत ब्याक्टेरिया ल्याः छ्यलाः प्रत्येक नमूनाया निंतिं बैसिलस/ब्याक्टेरोइडेट्स अनुपातया गणना याःगु खः । तालिकाय् रिपोर्ट यानातःगु मानयात ४ दशमलव थासय् गोल याइ । सिम्पसन डाइभर्सिटी इन्डेक्सया गणना क्राकेनटुल्स v. ब्राकेन रिपोर्ट लिपिइ बियातःगु दु व -an प्यारामिटरया निंतिं सिम्पसन इन्डेक्स “Si” बियातःगु दु। प्रचुरताय् महत्वपूर्ण भिन्नतायात औसत सीएलआर भिन्नता ≥ १ वा ≤ -१ कथं परिभाषित याःगु खः । ±१ या औसत सीएलआर अन्तरं छगू नमूना प्रकारया प्रचुरताय् २.७-गुणा वृद्धि जूगु संकेत बी। (+/-) चिं क्रमशः पीपीए नमूना व नियन्त्रण नमूनाय् ट्याक्सन अप्व दु कि मदु धकाः क्यनि। मान-व्हिटनी यू परीक्षण (विर्तानेन एट अल, २०२०) छ्यलाः महत्व निर्धारण याःगु खः । Statsmodels v. 0.14 (बेन्जामिनी व होचबर्ग, १९९५; सीबोल्ड व पर्कटोल्ड, २०१०) छ्येलातःगु ख, व बहु परीक्षणया निंतिं सुधार यायेत बेन्जामिनी-होचबर्ग प्रक्रिया छ्येलातःगु ख। तथ्यांकीय महत्व निर्धारण यायेत समायोजित p-मान ≤ ०.०५ यात थ्रेसहोल्डया रुपय् छ्यःगु खः ।
जीन एनोटेशन व सापेक्षिक प्रचुरता अनुमान मारंग एट अलं वर्णन यानातःगु प्रोटोकलया छगू परिमार्जित संस्करण छ्यला याःगु ख। (मरंग व अन्य, २०२३)। दकलय् न्हापां, ५०० बीपी स्वया चिधंगु कन्टिगयात सेककिट v. २.५.१ (शेन एट अल, २०१६) छ्यला सकल एसेम्बलीं लिकाःगु ख। ल्ययातःगु एसेम्बलियात अनंलि पान-मेटाजेनोमय् स्वानाबिल। खुल्ला ब्वनेगु फ्रेम (ओआरएफ)यात प्रोडिगल v. १.०.१ (प्रोडिगल v. २.६.३ या समानान्तर संस्करण) छ्यलाः क्वय् बियातःगु मापदण्डलिसे म्हसीकल : -d-एफ जिएफएफ-आइ -O-टी २४ -पी मेटा -सी १००००० (ह्याट एट अल।, २०१२; जेनिक, २०२४)। अनंलि लिच्वःया न्यूक्लियोटाइड फाइलयात पाइथन छ्यलाः फिल्टर यानाः फुक्क अपूर्ण जीनयात लिकयाबिल । सिडि-हिट भि. ४.८.१ अले क्वय् बियातःगु प्यारामिटर दुगु जीनयात क्लस्टर यायेत छ्यल : सिडि-हिट-इस्ट -आइ -O-सी ०.९५ -एस ०.८५ -एएस ०.९ -एन १० -डी २५६ -एम ३५०००० -टी २४ -एल १०० -जी १ (फू एट अल, २०१२)। जीन प्रचुरता व एनोटेशनया अनुमान यायेत उत्पन्न गैर-अनावश्यक जीन क्याटलग छ्यःगु खः । सापेक्ष जीन प्रचुरता केएमए v. १.४.९ (क्लाउसेन एट अल, २०१८) छ्यला अनुमानित याःगु ख। न्हापां, क्वय् बियातःगु प्यारामिटर दुगु केएमए इन्डेक्स छ्यलाः इन्डेक्स फाइल दयेकि : -i -Oअनंलि, बायोइन्फर्मेटिक्स पाइपलाइन खण्डय् वर्णन यानातःगु कथं प्रत्येक नमूनाया निंतिं माइक्रोबियल रिडया नापं उत्पन्न सूचकांक छ्यला, केएमएयात क्वय् बियातःगु मापदण्डलिसे चले याःगु खः : -i -O-टि_डिबि-bcNano -bc 0.7 -ef -t 24. अनंलि, सीएलआर छ्यला जीन ल्याः सामान्यीकरण याःगु खः, व Sci-kit लर्नया प्रिन्सिपल कम्पोनेन्ट एनालिसिस (पीसीए) वर्ग छ्यःगु खः (पेड्रेगोसा एट अल, २०११) । अनुमानित जीन एनोटेशन गैर-अनावश्यक जीन क्याटलगय् eggNOG v. २.१.१२ या emapper.py लिपि व eggNOG डाटाबेस भर्सन ५.०.२ छ्यला क्वय् बियातःगु मापदण्ड नापं याःगु ख: –itype CDS –cpu २४ -i– डाटा क्याटलग- हुँ_ प्रमाण गैर-इलेक्ट्रोनिक - लिच्वः– आउटपुट डाइरेक्टरि–लक्ष्य_अर्थोलोग सकलें –बीज_अर्थोलोग_मूल्यांकन ०.००१ –बीज_अर्थोलोग_स्कोर ६० –प्रश्न_कभर २० –विषय_कभर ० –अनुवाद –ओभरराइड –अस्थायी_निर्देशक(कैन्टालापिएड्रा व अन्य, २०२१)। केएमएया लिच्वःयात पर्याप्त टेम्प्लेट कभरेज व टेम्प्लेट पहिचान (≥ ९०%) व प्रचुरता (गहिराइ ≥ ३) दूगु जीन ल्ययेत स्क्रिन याःगु खः । केएमए गहिराइया लिच्वःयात च्वय् वर्णन यानातःकथं सिएलआर छ्यलाः हिलाबिल । अनंलि केएमएया लिच्वःयात प्रत्येक जीनया निंतिं कन्टिग स्रोत छ्यला फंक्शनल एनोतेसन व वर्गीकरणया लिच्वःपाखें कन्टिग आइडीनाप तुलना याःगु ख। ट्याक्सा थें हे, जीनया प्रचुरताय् महत्त्वपूर्ण भिन्नतायात औसत सीएलआर भिन्नता ≥ १ वा ≤ -१ दूगु जीनया रुपय् परिभाषित याःगु ख, गुकिलि छगू चिं (+/-) नापं क्रमशः पीपीए वा नियन्त्रण नमूनाय् जीन अप्व प्रचुर मात्राय् दूगु क्यनि।
जीनयात दकलय् न्हापां क्योटो इन्साइक्लोपेडिया अफ जीन्स एण्ड जीनोम्स (केईजीजी) अर्थोलोग (केओ) आइडेन्टिफायर कथं एगएनओजीं बियातःगु जीन पथया प्रचुरताया तुलना यायेत पुचलय् तःगु ख। नकआउट मदुगु जीन बाय् यक्व नकआउट दुगु जीनयात विश्लेषण याये न्ह्यः लिकया बिल । अनंलि प्रति नमूना प्रत्येक केओया औसत प्रचुरताया गणना यानाः तथ्यांकीय विश्लेषण याःगु खः । पीपीए मेटाबोलिज्म जीनयात छुं नं जीनया रुपय् परिभाषित याःगु ख गुकियात केईजीजी_पथवे स्तम्भय् छगू पंक्ति ko00640 बियातःगु दु, गुकिलिं केईजीजी कथं प्रोपिओनेट मेटाबोलिज्मय् भूमिका क्यनि। पीपीए उत्पादननाप स्वापू दूगु कथं म्हसीकातःगु जीन पूरक तालिका १ (राइचार्ड व मेमेपिं, २०१४; याङ व मेमेपिं, २०१७)य् बियातःगु दु। प्रत्येक नमूना प्रकारय् उल्लेखनीय रुपं अप्व प्रचुर मात्राय् दूगु पीपीए मेटाबोलिज्म व उत्पादन जीन म्हसीकेत पर्मुतेसन परीक्षण याःगु ख। विश्लेषण यानातःगु प्रत्येक जीनया निंतिं छगू हजार पर्मुटेशन याःगु खः । तथ्यांकीय महत्व निर्धारण यायेत कटअफया रुपय् ०.०५ या पी-भ्यालु छ्यःगु खः । क्लस्टर दुनेया प्रतिनिधि जीनया एनोतेसनया आधारय् छगू क्लस्टर दुनेया व्यक्तिगत जीनयात फंक्शनल एनोतेसन बियातःगु ख। पीपीए मेटाबोलिज्म व/वा पीपीए उत्पादननाप स्वापू दूगु ट्याक्सायात क्राकेन२ आउटपुट फाइलय् कन्टिग आईडीयात eggNOG छ्यला फंक्शनल एनोतेसनया इलय् तयातःगु व हे कन्टिग आईडीनाप मिले यानाः म्हसीकेछिं। न्हापा वर्णन यानातःगु मान-व्हिटनी यू परीक्षण छ्यलाः महत्व परीक्षण याःगु खः । बेन्जामिनी-होचबर्ग प्रक्रिया छ्यलाः तःगू परीक्षणया निंतिं सुधार याःगु खः । तथ्यांकीय महत्व निर्धारण यायेत कटअफया रुपय् ≤ ०.०५ या p-value छ्यःगु खः ।
सिम्पसन डाइभर्सिटी इन्डेक्स छ्यलाः छुँया आन्द्रा माइक्रोबायोमया विविधताया मूल्यांकन याःगु खः । नियन्त्रण व पीपीए नमूना दथुइ जीनस व प्रजातिया विविधताया ल्याखं छुं नं उल्लेखनीय भिन्नता खने मदु (जीनसया निंतिं पी-मान : ०.१८, प्रजातिया निंतिं पी-मान : ०.१६) (चित्र १) । अनंलि प्रिन्सिपल कम्पोनेन्ट एनालिसिस (पिसिए) छ्यलाः माइक्रोबियल कम्पोजिसनया तुलना याःगु खः । चित्र २ य् नमूनाया क्लस्टरिङ इमिगु फाइल कथं क्यनातःगु दु, गुकिलिं पीपीए व नियन्त्रण नमूना दथुइ माइक्रोबायोमया प्रजाति संरचनाय् भिन्नता दूगु संकेत बी। थ्व क्लस्टरिङ जीनस स्तरय् म्हो जक खनेदत, गुकिलिं पीपीएयात छुं ब्याक्टेरियायात प्रभावित याइगु सुझाव बी (पूरक चित्र १)।
किपा १.माउस आन्द्रा माइक्रोबायोमया जेनेरा व प्रजातिया संरचनाया अल्फा विविधता। पीपीए व नियन्त्रण नमूनाय् जेनेरा (ए) व प्रजाति (बी)या सिम्पसन विविधता सूचकांक क्यनाच्वंगु बक्स प्लाट। मान-व्हिटनी यू परीक्षण छ्येला महत्त्व निर्धारण याःगु ख, व बेन्जामिनी-होचबर्ग प्रक्रिया छ्येला मल्टिपल करेक्सन याःगु ख। एनएस, पि-भ्यालु उल्लेखनीय मजू (पि>०.०५)।
चित्र २.प्रजाति स्तरय् माउस आन्द्रा माइक्रोबायोम संरचनाया प्रमुख घटक विश्लेषणया लिच्वः। मू घटक विश्लेषण प्लाटं इमिगु न्हापांगु निगू मू घटकय् नमूनाया वितरण क्यनी। उं नमूनाया ताजि क्यनी : पिपिए-एक्सपोज जूगु छुँ प्याजि व नियन्त्रण छुँ म्हासु । मू घटक १ व २ क्रमशः x-अक्ष व y-अक्षय् प्लाट यानातःगु दु व इमिगु व्याख्याित भ्यारियन्स रेसियोया रुपय् व्यक्त यानातःगु दु।
आरएलई ट्रान्सफर्मेड काउन्ट डाटा छ्यला नियन्त्रण व पीपीए मुस्याय् मेडियन ब्याक्टेरोइडेट्स/बेसिली अनुपातय् उल्लेखनीय कमी खनेदु (नियन्त्रण: ९.६६, पीपीए: ३.०२; पी-भ्यालु = ०.००११)। थ्व अन्तर नियन्त्रणया तुलनाय् पीपीए मुस्याय् ब्याक्टेरोइडेट्सया प्रचुरता अप्वः जूगुलिं जूगु खः, यद्यपि थ्व अन्तर उल्लेखनीय मजू (नियन्त्रण माध्य सीएलआर: ५.५१, पीपीए माध्य सीएलआर: ६.६२; पी-मूल्य = ०.०५४), जबकि ब्याक्टेरोइडेट्सया प्रचुरता समान खनेदु (नियन्त्रण माध्य सीएलआर.६पीए.७ पि-मान = ०.१८)।
आन्द्रा माइक्रोबायोमया ट्याक्सोनोमिक सदस्यया प्रचुरताया विश्लेषणं १ फाइलम व ७७ प्रजातिया पीपीए व नियन्त्रण नमूना दथुइ यक्व भिन्नता खने दु (पूरक तालिका २)। पीपीए नमूनाय् ५९ प्रजातिया प्रचुरता नियन्त्रण नमूना स्वयां यक्व अप्वः खनेदुसा नियन्त्रण नमूनाय् १६ प्रजातिया जक प्रचुरता पीपीए नमूना स्वयां अप्वः खनेदु (चित्र ३) ।
चित्र ३ - पीपीए व नियन्त्रण मुस्याया आन्द्रा माइक्रोबायोमय् ट्याक्साया विभेदक प्रचुरता। ज्वालामुखी प्लाटं पीपीए व नियन्त्रण नमूना दथुइ जेनेरा (ए) वा प्रजाति (बी)या प्रचुरताय् भिन्नता क्यनि। सिइसे च्वंगु बिन्दुं ट्याक्साया प्रचुरताय् छुं नं उल्लेखनीय भिन्नता मदु धकाः क्यनी । रंगीन बिन्दुतसें प्रचुरताय् महत्वपूर्ण भिन्नता क्यनी (p-value ≤ 0.05)। नमूना प्रकार दथुइ प्रचुरताय् दकलय् अप्व अन्तर दूगु शीर्ष २० ट्याक्सा क्रमशः ह्याउँगु व हल्का वँचुगु (नियन्त्रण व पीपीए नमूना)य् क्यनातःगु दु। नियन्त्रण वा पीपीए नमूनाय् नियन्त्रणया तुलनाय् म्हासुगु व बैजनी रंगया बिन्दु कम्ती नं २.७ गुणा अप्वः खनेदूगु खः । ब्ल्याक डटं उल्लेखनीय रुपं फरक प्रचुरता दूगु ट्याक्सायात प्रतिनिधित्व याइ, गुकिलि -१ व १ दथुइ औसत सीएलआर अन्तर दइ।पी मूल्यया गणना मान-व्हिटनी यू परीक्षण छ्येला याःगु ख व बेन्जामिनी-होचबर्ग प्रक्रिया छ्येला बहु परीक्षणया निंतिं सुधार याःगु ख। बोल्ड मीन सिएलआरया भिन्नतां प्रचुरताय् महत्वपूर्ण भिन्नता क्यनी ।
आन्द्राया माइक्रोबियल कम्पोजिसनया विश्लेषण यायेधुंकाः, जिमिसं माइक्रोबायोमया फंक्शनल एनोटेशन याना । कम गुणस्तरया जीनयात फिल्टर यायेधुंकाः फुक्क नमूनाय् मुक्कं ३ लख ७८ हजार ३५५ गू अद्वितीय जीन म्हसीकूगु खः । थ्व जीनया रुपान्तरित प्रचुरतायात प्रिन्सिपल कम्पोनेन्त एनालिसिस (पीसीए)या निंतिं छ्येलातःगु ख, व लिच्वःतेसं इमिगु क्रियाशील प्रोफाइलया आधारय् नमूना प्रकारया उच्च स्तरया क्लस्टरिङ क्यंगु दु (चित्र ४)।
किपा ४. माउस आन्द्रा माइक्रोबायोमया फंक्शनल प्रोफाइल छ्यलाः पीसीए लिच्वः । पिसिए प्लाटं इमिगु न्हापांगु निगू मू घटकय् नमूनाया वितरण क्यनी । उं नमूनाया ताजि क्यनी : पिपिए-एक्सपोज जूगु छुँ प्याजि व नियन्त्रण छुँ म्हासु । मू घटक १ व २ क्रमशः x-अक्ष व y-अक्षय् प्लाट यानातःगु दु व इमिगु व्याख्याित भ्यारियन्स रेसियोया रुपय् व्यक्त यानातःगु दु।
जिमिसं लिपा थी थी नमूना ताजिया केइजिजि नकआउटया प्रचुरतायात जाँच याना । मुक्कं ३६४८ अद्वितीय नकआउट पहिचान याःगु खः, गुकी १९६ नियन्त्रण नमूनाय् उल्लेखनीय रुपं अप्वः व १०६ पीपीए नमूनाय् अप्वः खनेदूगु खः (चित्र ५) । नियन्त्रण नमूनाय् मुक्कं १४५ जीन व पीपीए नमूनाय् ६१ जीन लुयावःगु दु, गुकिया प्रचुरता उल्लेखनीय रुपं फरक खनेदु। लिपिड व एमिनोसुगर मेटाबोलिज्मलिसे स्वापू दूगु लँपुत पीपीए नमूनाय् उल्लेखनीय रुपं अप्वः समृद्ध खनेदु (पूरक तालिका ३) । नाइट्रोजन मेटाबोलिज्म व सल्फर रिले प्रणालीनाप स्वापू दूगु लँपु नियन्त्रण नमूनाय् उल्लेखनीय रुपं अप्व समृद्ध जुल (पूरक तालिका ३)। एमिनोसुगर/न्युक्लियोटाइड मेटाबोलिज्म (ko:K21279) व इनोसिटोल फस्फेट मेटाबोलिज्म (ko:K07291) नाप स्वापू दूगु जीनया प्रचुरता पीपीए नमूनाय् यक्व अप्व खनेदु (चित्र ५)। नियन्त्रण नमूनाय् बेन्जोएट मेटाबोलिज्म (ko:K22270), नाइट्रोजन मेटाबोलिज्म (ko:K00368), व ग्लाइकोलाइसिस/ग्लुकोनियोजेनेसिस (ko:K00131) नाप स्वापू दूगु जीन उल्लेखनीय रुपं अप्व खने दु ( चित्र ५ )।
चित्र ५ - पीपीए व नियन्त्रण मुस्याया आन्द्रा माइक्रोबायोमय् केओया विभेदक प्रचुरता। ज्वालामुखीया प्लाटं क्रियाशील पुचः (केओएस)या प्रचुरताय् भिन्नता क्यनी । ग्रे डटं केओयात क्यनि गुकिया प्रचुरता नमूना प्रकारया दथुइ उल्लेखनीय रुपं फरक मजू (p-value > 0.05)। रंगीन बिन्दुतसें प्रचुरताय् महत्वपूर्ण भिन्नता क्यनी (p-value ≤ 0.05)। नमूना प्रकारया दथुइ दकलय् अप्व प्रचुरताय् अन्तर दूगु २० केओयात क्रमशः नियन्त्रण व पीपीए नमूनानाप स्वापू दूगु ह्याउँगु व हल्का वँचुगु रंगय् क्यनातःगु दु। म्हासुगु व बैजनी रंगया बिन्दुतसें नियन्त्रण व पीपीए नमूनाय् क्रमशः कम्ती नं २.७ गुणा अप्वः प्रचुर मात्राय् दुगु केओयात क्यनी । ब्ल्याक डटं उल्लेखनीय रुपं फरक प्रचुरता दूगु केओयात क्यनि, -१ व १ दथुइ औसत सीएलआर अन्तर दु।पी मूल्यया गणना मान-व्हिटनी यू परीक्षण छ्यला याःगु ख व बेन्जामिनी-होचबर्ग प्रक्रिया छ्यला बहु तुलना यायेत समायोजन याःगु ख। एनएनं केओ केइजिजिया लँपुइ मदु धकाः क्यनी । बोल्ड मीन सिएलआर पाःगु मानं प्रचुरताय् उल्लेखनीय पाःगु क्यनी । धलखय् लाःगु केओत गुगु लँपुइ लाः धयागु खँय् पूवंक जानकारिया निंतिं, पूरक तालिका ३ स्व ।
एनोतेतेद जीन मध्ये १६०१ जीनय् नमूना प्रकार (p ≤ ०.०५) दथुइ उल्लेखनीय रुपं फरक प्रचुरता दु, गुकिलि प्रत्येक जीनय् म्हो ल्याखय् २.७-गुणा अप्व प्रचुरता दु। थ्व जीन मध्ये नियन्त्रण नमूनाय् ४ जीन अप्व व पीपीए नमूनाय् १५९७ जीन अप्व खने दु। पीपीएय् एन्टिमाइक्रोबियल गुण दुगुलिं जिमिसं नमूना प्रकार दथुइ पीपीए मेटाबोलिज्म व उत्पादन जीनया प्रचुरताया जाँच याना। १३३२ पीपीए मेटाबोलिज्म सम्बन्धी जीन मध्ये २७ जीन नियन्त्रण नमूनाय् उल्लेखनीय रुपं अप्वः व १२ जीन पीपीए नमूनाय् अप्वः खनेदूगु खः । २२३ पीपीए उत्पादन सम्बन्धी जीन मध्ये १ जीन पीपीए नमूनाय् उल्लेखनीय रुपं अप्वः खनेदूगु खः । चित्र ६ ए नं पीपीए मेटाबोलिज्मय् संलग्न जीनया अप्व प्रचुरतायात अझ क्यनि, नियन्त्रण नमूनाय् उल्लेखनीय रुपं अप्व प्रचुरता व तःधंगु प्रभाव आकारय्, धाःसा चित्र ६ बीं पीपीए नमूनाय् अवलोकन जूगु उल्लेखनीय अप्व प्रचुरता दूगु व्यक्तिगत जीनयात उजागर याइ।
किपा ६. छुँया आन्द्रा माइक्रोबायोमय् पिपिएलिसे स्वापू दुगु जीनया विभेदक प्रचुरता । ज्वालामुखी प्लाटय् पीपीए मेटाबोलिज्म (ए) व पीपीए उत्पादन (बी) नाप स्वापू दूगु जीनया प्रचुरताय् अन्तर क्यनातःगु दु। ग्रे डटं थुज्वःगु जीनयात क्यनि गुकिया प्रचुरता नमूना प्रकारया दथुइ उल्लेखनीय रुपं फरक मजू (p-value > 0.05)। रंगीन बिन्दुतसें प्रचुरताय् महत्वपूर्ण भिन्नता क्यनी (p-value ≤ 0.05)। प्रचुरताय् दकलय् अप्व अन्तर दूगु २० जीन क्रमशः ह्याउँगु व हल्का वँचुगु (नियन्त्रण व पीपीए नमूना)य् क्यनातःगु दु। नियन्त्रण व पीपीए नमूनाय् नियन्त्रण नमूना स्वयां म्हासुगु व बैजनी रंगया बिन्दुया प्रचुरता कम्ती नं २.७ गुणा अप्वः खनेदूगु खः । ब्ल्याक डटं उल्लेखनीय रुपं फरक प्रचुरता दूगु जीनया प्रतिनिधित्व याइ, गुकिलि -१ व १ दथुइ औसत सीएलआर अन्तर दइ।पी मूल्यया गणना मान-व्हिटनी यू परीक्षण छ्येला याःगु ख व बेन्जामिनी-होचबर्ग प्रक्रिया छ्येला यक्व तुलना यायेत संशोधन याःगु ख। जीन गैर-अनावश्यक जीन क्याटलगय् प्रतिनिधि जीननाप मेल खनी। जीनया नां केओ जीन क्यनीगु केइजिजि चिं दइ । बोल्ड मीन सिएलआरया पाःगुलिं उल्लेखनीय रुपं पाःगु प्रचुरता क्यनी । केइजिजि डाटाबेसय् जीनया निंतिं छुं नं चिं मदु धकाः ड्यास (-) क्यनी ।
पीपीए मेटाबोलिज्म व/वा उत्पादननाप स्वापू दूगु जीन दूगु ट्याक्सायात कन्टिगया ट्याक्सोनोमिक पहिचानयात जीनया कन्टिग आइडीनाप मिले याना म्हसीकातःगु ख। जीनस स्तरय् १३० जेनेराय् पीपीए मेटाबोलिज्मनाप स्वापू दूगु जीन व ६१ जेनेराय् पीपीए उत्पादननाप स्वापू दूगु जीन दूगु खने दु (पूरक तालिका ४)। अथे जुसां छुं नं जेनेरां प्रचुरताय् उल्लेखनीय भिन्नता क्यंगु मदु (p > 0.05)।
प्रजाति स्तरय् १४४ ब्याक्टेरिया प्रजातिइ पीपीए मेटाबोलिज्मलिसे स्वापू दूगु जीन व ६८ ब्याक्टेरिया प्रजातिइ पीपीए उत्पादनलिसे स्वापू दूगु जीन खनेदूगु खः (पूरक तालिका ५) । पीपीए मेटाबोलाइजर मध्ये ८गु ब्याक्टेरियां नमूना प्रकारया दथुइ प्रचुरताय् उल्लेखनीय वृद्धि क्यंगु दु, व फुक्कं प्रभावय् उल्लेखनीय हिउपाः क्यंगु दु (पूरक तालिका ६)। प्रचुरताय् उल्लेखनीय भिन्नता दुगु दक्वं पहिचान यानातःगु पीपीए मेटाबोलाइजरत पीपीए नमूनाय् अप्वः प्रचुर मात्राय् खनेदत । प्रजाति-स्तरीय वर्गीकरणं नमूना प्रकारया दथुइ उल्लेखनीय भिन्नता मदुगु जेनेराया प्रतिनिधित लुइकल, गुकिलि यक्व ब्याक्टेरोइड व रुमिनोकोकस प्रजाति, नापं डन्केनिया डुबोइस, माइक्सोब्याक्टेरियम एन्टेरिका, मोनोकोकस पेक्टिनोलाइटिकस, व एल्कालिजेन्स पोलिमोर्फा नं ला। पीपीए-उत्पादक ब्याक्टेरिया मध्ये प्यंगू ब्याक्टेरियां नमूना प्रकारया दथुइ प्रचुरताय् उल्लेखनीय भिन्नता क्यंगु दु । प्रचुरताय् उल्लेखनीय भिन्नता दूगु प्रजातिइ ब्याक्टेरोइड्स नोभोरोसी, डन्केनिया डुबोइस, माइक्सोब्याक्टेरियम एन्टेरिटिडिस, व रुमिनोकोकस बोभिस ला।
थुगु अध्ययनय्, जिमिसं छुँया आन्द्रा माइक्रोबायोटाय् पिपिए एक्सपोजरया प्रभावया जाँच याना । पीपीए ब्याक्टेरियाय् थी-थी प्रतिक्रिया पिकायेफु छाय् धाःसा थ्व छुं प्रजातिं उत्पादन याइ, मेमेगु प्रजातिं नसाया स्रोतया रुपय् छ्येलि, वा एन्टिमाइक्रोबियल प्रभाव दइ। अतः, आहारया पूरकया माध्यमं आन्द्राया वातावरणय् थुकियात थप यायेबलय् सहिष्णुता, संवेदनशीलता, व पोषक तत्वया स्रोतया रुपय् छ्येलेगु क्षमताया आधारय् थी-थी प्रभाव जुइफु। संवेदनशील ब्याक्टेरिया प्रजातियात मदयेकाः पीपीए प्रतिरोधी वा खाद्य स्रोतया रुपय् छ्यलेफुगु ब्याक्टेरियाया प्रजातिं प्रतिस्थापन यायेफु, गुकिलिं आन्द्रा माइक्रोबायोटाया संरचनाय् हिउपाः वइ। जिमिगु लिच्वलं माइक्रोबियल संरचनाय् उल्लेखनीय भिन्नता क्यन तर समग्र माइक्रोबियल विविधताय् छुं प्रभाव मजू । दकलय् अप्व प्रभाव प्रजाति स्तरय् खने दु, गुकिलि पीपीए व नियन्त्रण नमूना दथुइ ७० स्वया अप्व ट्याक्सा प्रचुरताय् उल्लेखनीय रुपं फरक खनेदु (पूरक तालिका २)। पीपीए-एक्सपोज जूगु नमूनाया संरचनाया थप मूल्यांकनं एक्सपोज मजूगु नमूनाया तुलनाय् माइक्रोबियल प्रजातिया अप्व विषमता खनेदत, गुकिलिं पीपीए ब्याक्टेरियाया वृद्धि विशेषता अप्वयेकेफु व पीपीए-समृद्ध वातावरणय् म्वायेफुगु ब्याक्टेरियाया जनसंख्यायात सीमित यायेफु धकाः सुझाव बी। थुकथं, पीपीए नं आन्द्रा माइक्रोबायोटा विविधताय् व्यापक रुपं व्यवधान हयेगु स्वया चयनात्मक रुपं हिउपाः हयेफु।
पीपीए थें न्याःगु खाद्य परिरक्षक पदार्थं थ्व स्वया न्ह्यः समग्र विविधतायात प्रभावित मयासे आन्द्रा माइक्रोबायोमया घटकया प्रचुरताय् हिउपाः हयेगु क्यनातःगु दु (नागपाल व मेमेपिं, २०२१)। थन, जिमिसं फाइलम ब्याक्टेरोइडेट्स (न्हापा ब्याक्टेरोइडेट्सया नामं म्हसीकातःगु) दुनेया ब्याक्टेरोइडेट्स प्रजाति दथुइ दकलय् आकर्षक भिन्नता अवलोकन याना, गुकिलिं पीपीए-एक्सपोज जूगु मुस्याय् उल्लेखनीय रुपं समृद्ध जुल। ब्याक्टेरोइड्स प्रजातिया अप्वःगु प्रचुरता अप्वःगु म्युकस अपघटनलिसे स्वापू दु, गुकिलिं संक्रमणया जोखिम अप्वयेकेफु व इन्फ्लेमेशनयात प्रोत्साहन बीफु (कोर्निक व मेमेपिं, २०१५; देसाई व मेमेपिं, २०१६; पेन्जोल व मेमेपिं, २०१९)। छगू अध्ययनं ब्याक्टेरोइड्स फ्राजिलिसया वासः याःगु नवजात मिजं मुस्याय् अटिज्म स्पेक्ट्रम डिसअर्डर (एएसडी)या लुमन्तिइ सामाजिक व्यवहार खनेदूगु खनेदु (कार्मेल एट अल, २०२३), व मेमेगु अध्ययनं क्यंगु दु कि ब्याक्टेरोइड्स प्रजातिं प्रतिरक्षा गतिविधिइ हिउपाः हयेफु व अटोइम्युन एल्जिओइलपेरु ( अटोइम्युन कार्योपेरुइल इन्फ्लेमेटरी ( alGyomC. २०१९)। पीपीएया संपर्कय् वःपिं मुस्याय् रुमिनोकोकस, प्रिभोटेला, व पाराब्याक्टेरोइड्स जेनेराय् लाःगु प्रजाति नं यक्व अप्वःगु खनेदु (कोरेट्टी एट अल, २०१८)। छुं रुमिनोकोकस प्रजाति प्रोइन्फ्लेमेटरी साइटोकाइनया उत्पादनया माध्यमं क्रोहन ल्वे थें न्याःगु ल्वेनाप स्वापू दु (हेन्के एट अल, २०१९), धाःसा प्रिभोटेला एट अल ह्युमानि थें न्याःगु मेटाबोलिक ल्वे नाप स्वापू दु गथेकि हाइपरटेन्सन, इन्सुलिन एट अल२सेन्सिटिभिटी।० २०१७)। अन्तय्, जिमिसं ब्याक्टेरोइडेट्स (न्हापा फर्मिक्युट्सया नामं म्हसीकिगु) व ब्याक्टेरोइडेट्सया अनुपात नियन्त्रण मुस्या स्वया पीपीए-एक्सपोजर मुस्याय् यक्व म्हो खने दु छाय् धाःसा ब्याक्टेरोइडेट्स प्रजातिया कुल प्रचुरता अप्व दु। थ्व अनुपात न्हापा आन्तरिक होमियोस्टेसिसया छगू महत्त्वपूर्ण सूचकया रुपय् क्यनातःगु दु, व थ्व अनुपातय् विकार थी-थी ल्वे अवस्थानाप स्वापू दूगु खने दु (टर्पिन व मेमेपिं, २०१६; ताकेजावा व मेमेपिं, २०२१; एन व मेमेपिं, २०२३), गुकिलि भडकाऊ आन्द्राया ल्वे (Stov,20.20) नं ला। सामूहिक रुपं, फाइलम ब्याक्टेरोइडेट्सया प्रजातित अप्वःगु आहारया पीपीएया कारणं दकलय् अप्वः प्रभावित जुइगु खनेदु । थ्व पीपीए प्रति अप्व सहिष्णुता वा पीपीएयात ऊर्जा स्रोतया रुपय् छ्येलेगु क्षमताया कारणं जुइफु, गुगु कम्ती नं छगू प्रजाति होयलेसेला इनोसिया (हिच एट अल, २०२२)या निंतिं सत्य जूगु क्यनातःगु दु। वैकल्पिक रुपय्, मातृ पीपीए एक्सपोजरं मुस्याया सन्तानया आन्द्रायात ब्याक्टेरोइडेट्स उपनिवेशीकरणया निंतिं अप्व संवेदनशील याना भ्रूणया विकास अप्वयेकेफु; न्ह्याथेसां, जिमिगु अध्ययन डिजाइनं थुजाःगु मूल्यांकन यायेत अनुमति मब्यू ।
मेटाजेनोमिक कन्टेन्ट मूल्यांकनं पीपीए मेटाबोलिज्म व उत्पादनलिसे स्वापू दूगु जीनया प्रचुरताय् उल्लेखनीय भिन्नता क्यंगु दु, पीपीए-एक्सपोजर मुस्याय् पीपीए उत्पादनया निंतिं जिम्मेवार जीनया अप्वः प्रचुरता खनेदत, जबकि गैर-पीपीए-एक्सपोजर मुस्यातेसं पीपीए उत्पादनया निंतिं जिम्मेवार जीनया प्रचुरता अप्वः क्यन (चित्र६)। थ्व लिच्वःतेसं माइक्रोबियल कम्पोजिसनय् पीपीएया प्रभाव थुकिया छ्येलेज्याया कारणं जक्क जुइमखु जुइफु, मखुसा पीपीए मेटाबोलिज्मनाप स्वापू दूगु जीनया प्रचुरता पीपीए-एक्सपोजर जूगु मुस्याया आन्द्रा माइक्रोबायोमय् अप्व प्रचुरता क्यनेमाःगु ख। छगू व्याख्या थ्व ख कि पीपीए ब्याक्टेरियाया प्रचुरतायात ब्याक्टेरियां पोषक तत्वया रुपय् छ्येलेगु स्वया मू कथं थुकिया एन्टिमाइक्रोबियल प्रभावया माध्यमं मध्यस्थता याइ। थ्व स्वया न्ह्यःया अध्ययनं क्यंगु दु कि पीपीए नं साल्मोनेला टाइफिमुरियमया वृद्धियात खुराकय् निर्भर जुइगु कथं पनेफु (जेकबसन एट अल, २०१८)। पीपीएया अप्व मात्राय् एक्सपोजरं ब्याक्टेरियाया निंतिं ल्ययेफु गुकिलिं थुकिया एन्टिमाइक्रोबियल गुण प्रतिरोधी जुइ व थुकियात मेटाबोलाइज वा उत्पादन यायेत अनिवार्य रुपं सक्षम जुइमखु। दसुया निंतिं, यक्व पाराब्याक्टेरोइड प्रजातिं पीपीए नमूनाय् यक्व अप्व प्रचुरता क्यंगु दु, तर पीपीए मेटाबोलिज्म वा उत्पादननाप स्वापू दूगु छुं नं जीन लुयावःगु मदु (पूरक तालिका २, ४, व ५)। थ्व बाहेक, किण्वन उपोत्पादया रुपय् पीपीए उत्पादन थी-थी ब्याक्टेरिया दथुइ व्यापक रुपं वितरण जुयाच्वंगु दु (गोन्जालेज-गार्सिया एट अल, २०१७)। नियन्त्रण नमूनाय् पीपीए मेटाबोलिज्मनाप स्वापू दूगु जीनया अप्व प्रचुरताया कारण अप्व ब्याक्टेरियाया विविधता जुइफु (एभेरिना एट अल, २०२०)। थ्व बाहेक, १३३२ जीन मध्ये २७ (२.१४%) जक्क पीपीए मेटाबोलिज्मनाप जक्क स्वापू दूगु जीन जुइगु अनुमान याःगु दु। पिपिए मेटाबोलिज्मनाप स्वापू दूगु यक्वं जीनत मेगु मेटाबोलिक लँपुइ नं दुथ्याः । थुकिलिं अझ क्यनि कि नियन्त्रण नमूनाय् पीपीए मेटाबोलिज्मय् दुथ्याइगु जीनया प्रचुरता अप्व खने दु; थ्व जीनं थुज्वःगु लँपुइ ज्या यायेफु गुकिया लिच्वः कथं पीपीएया छ्येलेज्या वा उपोत्पादया रुपय् गठन जुइमखु। थ्व अवस्थाय्, पीपीए पुस्तानाप स्वापू दूगु छगू जक्क जीनं नमूना प्रकार दथुइ प्रचुरताय् उल्लेखनीय भिन्नता क्यंगु दु। पीपीए मेटाबोलिज्मनाप स्वापू दूगु जीनया विपरीत पीपीए उत्पादनया निंतिं मार्कर जीन ल्यःगु ख छाय् धाःसा थ्व जीन पीपीए उत्पादनया निंतिं ब्याक्टेरियाया लँपुइ प्रत्यक्ष रुपं संलग्न जुइ। पीपीए-एक्सपोजर मुस्याय्, फुक्क प्रजातिइ पीपीए उत्पादन यायेगु प्रचुरता व क्षमताय् उल्लेखनीय वृद्धि जूगु खनेदु। थुकिं पीपीएतय्सं पीपीए उत्पादक ल्यइगु अनुमानयात समर्थन याइ व उकिं पीपीए उत्पादन क्षमता अप्वइगु अनुमान याइ । अथे जुसां जीनया प्रचुरता जीन अभिव्यक्तिनाप अनिवार्य रुपं स्वापू मदु; थुकथं, नियन्त्रण नमूनाय् पीपीए मेटाबोलिज्म नाप स्वापू दूगु जीनया प्रचुरता अप्व जूसां अभिव्यक्ति दर फरक जुइफु (शि एट अल, २०१४)। पीपीए-उत्पादक जीन व पीपीए उत्पादनया प्रचलन दथुइ स्वापू पुष्टि यायेत पीपीए उत्पादनय् संलग्न जीनया अभिव्यक्तिया अध्ययन यायेमाःगु आवश्यकता दु।
पिपिए व कन्ट्रोल मेटाजेनोमया फंक्शनल एनोटेशनं छुं भिन्नता क्यन । जीन सामग्रीया पीसीए विश्लेषणं पीपीए व नियन्त्रण नमूना दथुइ असतत क्लस्टर खनेदत (चित्र ५)। भिन्ड-स्याम्पल क्लस्टरिङं नियन्त्रण जीनया सामग्री अप्व विविधता दुगु खने दु धाःसा पीपीए नमूना छथाय् क्लस्टर जुल। जीन सामग्री कथं क्लस्टरिङ्ग प्रजातिया संरचनाकथं क्लस्टरिङ्गलिसे तुलना यायेबहःजू । थुकथं, पथया प्रचुरताय् भिन्नता इमिगु दुनेया विशिष्ट प्रजाति व प्रजातिया प्रचुरताय् जुइगु हिउपानापं मेल खनि। पीपीए नमूनाय्, उल्लेखनीय रुपं अप्व प्रचुरता दूगु निगु लँपु एमिनोसुगर/न्युक्लियोटाइड चिनी मेटाबोलिज्म (ko:K21279) व मल्टिपल लिपिड मेटाबोलिज्म लँपु (ko:K00647, ko:K03801; पूरक तालिका ३) नाप स्वापू दूगु खने दु। ko:K21279 नाप स्वापू दूगु जीन पीपीए नमूनाय् यक्व अप्व प्रजाति दूगु जेनेराय् छगू ब्याक्टेरोइड्स जीनस नाप स्वापू दूगु खने दु। थ्व एन्जाइमं क्याप्सुलर पोलिसेकेराइडयात व्यक्त याना प्रतिरक्षा प्रतिक्रियायात पनेत ताःलात (वाङ एट अल, २००८)। थुकिं यानाः पिपिए-एक्सपोज जूपिं छुँतय् के खनेदूगु ब्याक्टेरोइडेट्स अप्वःगु जुइफु । थुकिं पिपिए माइक्रोबायोमय् खनेदूगु अप्वःगु फ्याटी एसिड सिन्थेसिसयात पूरक याइ । ब्याक्टेरियां फ्याटी एसिड दयेकेगु निंतिं FASIIko:K00647 (fabB) लँपुया छ्येला याइ, गुकिलिं होस्ट मेटाबोलिक लँपुयात प्रभावित यायेफु (याओ व रक, २०१५; जोनसन एट अल, २०२०), व लिपिड मेटाबोलिज्मय् हिउपां न्युरोडेभलपमेन्टय् भूमिका म्हितेफु (यु एट अल, २०)। पीपीए नमूनाय् अप्वःगु प्रचुरता क्यंगु मेगु लँपु स्टेरोइड हार्मोन बायोसिन्थेसिस (ko:K12343) ख। आन्द्रा माइक्रोबायोटाया हार्मोनया स्तरयात प्रभावित यायेगु व हार्मोनं प्रभावित जुइगु क्षमता दथुइ उल्टा स्वापू दूगु प्रमाण अप्वयाच्वंगु दु, गुकिलिं स्टेरोइडया स्तर अप्वइगुलिं डाउनस्ट्रिम स्वास्थ्य लिच्वः जुइफु (तेटेल एट अल, २०१८)।
थुगु अध्ययन सीमितता व बिचाः मदुगु मखु । छगू महत्वपूर्ण भेद धयागु जिमिसं जनावरतय् गु शारीरिक मूल्यांकन मयानागु खः । अथे जूगुलिं माइक्रोबायोमय् जुइगु हिउपाः छुं नं ल्वय् नाप स्वापू दु कि मदु धकाः प्रत्यक्ष निष्कर्ष पिकायेगु सम्भव मजू । मेगु बिचाः यायेमाःगु खँ छु धाःसा थुगु अध्ययनय् दुथ्याःपिं छुँयात इमि मांयात थें हे नसा नकूगु खः । भविष्यया अध्ययनं पीपीए-समृद्ध आहारं पीपीए-मुक्त आहारय् हिलेबलय् माइक्रोबायोमय् थुकिया प्रभावय् सुधार जुइ लाकि मजुइ धकाः निर्धारण यायेफु । जिमिगु अध्ययनया छगू सीमितता, मेगु यक्वं थें, सीमित नमूना आकार खः । वैध निष्कर्ष पिकाये फःसां लिच्वःया विश्लेषण यायेबलय् तःधंगु नमूना आकारं अप्वः तथ्यांकीय शक्ति बी । आन्द्रा माइक्रोबायोमय् जुइगु हिउपाः व छुं नं ल्वे दथुइ स्वापू दूगु बारेय् निष्कर्ष पिकायेगुलि नं झी सावधान जुयाच्वना (याप एट अल, २०२१)। उमेर, लिंग, व आहार नापंया अलमल याइगु कारकं सूक्ष्मजीवया संरचनायात उल्लेखनीय रुपं प्रभावित यायेफु। थ्व कारकतेसं जटिल ल्वेनाप आन्द्रा माइक्रोबायोमया स्वापूया सम्बन्धय् साहित्यय् खनेदूगु असंगतियात व्याख्या यायेफु (जोनसन एट अल, २०१९; लागोड व नासर, २०२३)। दसुया निंतिं, एएसडी दूपिं पशु व मनुइ ब्याक्टेरोइडेट्स वंशया दुजःत अप्वइगु वा म्हो जुइगु क्यनातःगु दु (एन्जेलिस व मेमेपिं, २०१३; कुशक व मेमेपिं, २०१७)। अथे हे, भडकाऊ आन्द्रा ल्वे दुपिं ल्वगितेगु आन्द्रा संरचनाया अध्ययनं छगू हे ट्याक्साय् वृद्धि व कमी निगुलिं खने दु (वाल्टर्स व मेमेपिं, २०१४; फोर्ब्स व मेमेपिं, २०१८; उपाध्याय व मेमेपिं, २०२३)। लैंगिक पूर्वाग्रहया प्रभावयात सीमित यायेत जिमिसं लिंगया समान प्रतिनिधित्व सुनिश्चित यायेगु कुतः यानागु खः, गुकिं यानाः भिन्नता दकलय् अप्वः आहारं हे जुइगु सम्भावना दु । फंक्शनल एनोटेशनया छगू हाथ्या धयागु अनावश्यक जीन अनुक्रमयात चिइकेगु खः । झीगु जीन क्लस्टरिङ विधिइ ९५% अनुक्रम पहिचान व ८५% लम्बाई समानता माः, नापं ९०% एलाइन्मेन्ट कभरेज माः गुकिलिं मखुगु क्लस्टरिङयात मदयेके फइ। तर गुलिखे अवस्थाय् जिमिसं व हे एनोटेशन (दसु, एमयूटी) दूगु सीओजीत अवलोकन याना (चित्र ६) । थ्व अर्थोलोगत बिस्कं, विशिष्ट जेनेरानाप स्वापू दूगु वा थ्व जीन क्लस्टरिङ दृष्टिकोणया छगू सीमितता ख धकाः निर्धारण यायेत थप अध्ययनया आवश्यकता दु। फंक्शनल एनोतेसनया मेगु सीमितता सम्भावित गलत वर्गीकरण ख; ब्याक्टेरियाया जीन mmdA प्रोपिओनेट संश्लेषणय् संलग्न छगू ज्ञात एन्जाइम ख, तर केईजीजीं थ्व एन्जाइमयात प्रोपिओनेट मेटाबोलिक पथनाप स्वानाच्वंगु मदु। उकिया विपरीत, एससिपिबि व एमएमसिडि अर्थोलोग स्वापू दु । निर्धारित नकआउट मदुगु यक्व ल्याखय् जीनया लिच्वः कथं जीनया प्रचुरताया मूल्यांकन यायेबलय् पीपीए-सम्बन्धी जीनया पहिचान यायेमफइगु जुइफु। भविष्यया अध्ययनं मेटाट्रान्सक्रिप्टोम विश्लेषणं फाइदा काइ, गुकिलिं आन्द्रा माइक्रोबायोटाया क्रियाशील विशेषताया गहिरो थुइका बीफु व जीन अभिव्यक्तियात सम्भावित डाउनस्ट्रिम प्रभावनाप स्वायेफु। विशिष्ट न्यूरोडेभलपमेन्टल डिसअर्डर वा इन्फ्लेमेटरी बावेल डिजिज दूगु अध्ययनया निंतिं माइक्रोबायोम संरचनाय् जुइगु हिउपायात थ्व विकारनाप स्वायेत पशुतेगु शारीरिक व व्यवहारिक मूल्यांकनया आवश्यकता जुइ। आन्द्राया माइक्रोबायोमयात कीटाणुमुक्त मुस्याय् प्रत्यारोपण यायेगु थप अध्ययन नं माइक्रोबायोम ल्वय् या चालक वा विशेषता खः धकाः निर्धारण यायेत उपयोगी जुइ ।
सारांशय्, जिमिसं क्यना कि आहारया पीपीए आन्द्रा माइक्रोबायोटाया संरचना हिलेगु छगू कारकया रुपय् ज्या याइ। पीपीए एफडीए स्वीकृत परिरक्षक खः गुकियात थीथी नसाज्वलंय् व्यापक रुपं खनेदइ गुकियात दीर्घकालीन रुपं एक्सपोजर यायेबलय् सामान्य आन्द्राया वनस्पतिइ पंगः वयेफु । जिमिसं यक्व ब्याक्टेरियाया प्रचुरताय् हिउपाः खना, गुकिलिं पीपीए आन्द्रा माइक्रोबायोटाया संरचनायात प्रभावित यायेफु धकाः सुझाव बियाच्वंगु दु। माइक्रोबायोटाय् हिउपा वइबलय् छुं मेटाबोलिक पथया स्तरय् हिउपा वयेफु, गुकिलिं होस्ट स्वास्थ्यनाप स्वापू दूगु शारीरिक हिउपा वयेफु। माइक्रोबियल कम्पोजिसनय् आहारया पीपीएया प्रभावं डिस्बायोसिस वा मेमेगु ल्वे जुइफु कि मफु धकाः सीकेत थप अध्ययन यायेमाःगु आवश्यकता दु । थ्व अध्ययनं आन्द्रा संरचनाय् पीपीएया प्रभावं मनुया स्वास्थ्ययात गुकथं लिच्वः लाकेफु धइगु भविष्यया अध्ययनया निंतिं जग तइ।
थुगु अध्ययनय् न्ह्यब्वयातःगु डाटासेट अनलाइन रिपोजिटरिइ दु । भण्डारया नां व प्रवेश ल्याः खः : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/, पीआरजेएनए१०९२४३१ ।
थ्व पशु अध्ययनयात केन्द्रीय फ्लोरिडा विश्वविद्यालयया संस्थागत पशु हेरचाह व छ्यलाबुला समिति (UCF-IACUC) (पशु छ्यलाबुला अनुमति ल्याः: PROTO202000002) नं स्वीकृति ब्यूगु खः । थुगु अध्ययनं स्थानीय कानून, नियम व संस्थागत आवश्यकतायात पालना याइ ।
एनजी: अवधारणाकरण, डाटा क्यूरेशन, औपचारिक विश्लेषण, अनुसन्धान, पद्धति, सफ्टवेयर, दृश्य, लेखन (मूल मस्यौदा), लेखन (समीक्षा व सम्पादन)। ला: अवधारणाकरण, डाटा क्यूरेशन, पद्धति, संसाधन, लेखन (समीक्षा व सम्पादन)। एसएच : औपचारिक विश्लेषण, सफ्टवेयर, च्वज्या (समीक्षा व सम्पादन) । एसए : अनुसन्धान, च्वज्या (समीक्षा व सम्पादन) । मुख्य न्यायाधीश : अनुसन्धान, लेखन (समीक्षा व सम्पादन)। एसएन : अवधारणाकरण, परियोजना प्रशासन, संसाधन, पर्यवेक्षण, लेखन (समीक्षा व सम्पादन)। टिए : अवधारणा, परियोजना प्रशासन, पर्यवेक्षण, च्वज्या (समीक्षा व सम्पादन) ।
च्वमितेसं थ्व च्वसुया अनुसन्धान, च्वमित्व, व/वा प्रकाशनया निंतिं छुं नं आर्थिक ग्वाहालि मकाःगु घोषणा यात।
लेखकतय्सं घोषणा याःगु दु कि सम्भावित स्वार्थ द्वन्द्वया रुपय् व्याख्या यायेफइगु छुं नं कथंया व्यावसायिक वा आर्थिक सम्बन्धया अभावय् अनुसन्धान याःगु खः । लागु जुइ मखु ।
थ्व च्वसुइ न्ह्यथनातःगु फुक्कं बिचाः च्वमिपिनिगु जक खःसा उमिगु संस्था, प्रकाशक, सम्पादक वा समीक्षकया बिचाः जुइमाःगु मदु । थ्व च्वसुइ मूल्यांकन यानातःगु छुं नं उत्पादन, वा उकिया निर्मातातय्सं याःगु छुं नं दाबी, प्रकाशकं ग्यारेन्टी वा अनुमोदन याइमखु ।
थुगु च्वसुया निंतिं पूरक सामग्री अनलाइनय् लुइके फै :
अब्देली एलएस, समसम ए, नासर एसए (2019)। प्रोपियोनिक एसिडं अटिज्म स्पेक्ट्रम विकारय् पीटीईएन/एकेटी लँपुयात नियमित यानाः ग्लियोसिस व न्युरोइन्फ्लेमेशनयात प्रेरित याइ। वैज्ञानिक प्रतिवेदन ९, ८८२४–८८२४। डोइ : १०.१०३८/एस४१५९८-०१९-४५३४८-जेड
ऐचिसन, जे (१९८२). रचनात्मक तथ्यांकया तथ्यांकीय विश्लेषण । जेआर स्ट्याट सोक सेर बी मेथोडोल. ४४, १३९–१६०. डोइ : १०.११११/जे.२५१७-६१६१.१९८२.टिबि०११९५.एक्स
आह्न जे, क्वोन एच, किम वाईजे (2023). स्तन क्यान्सरया जोखिम कारकया रुपय् फर्मिक्यूट्स/ब्याक्टेरोइडेट्स अनुपात । क्लिनिकल मेडिसिनया जर्नल, १२, २२१६. डोइ: १०.३३९०/जेसिएम१२०६२२१६
एन्डर्स एस, ह्यूबर डब्ल्यू (2010). अनुक्रम ल्याः खायेगु तथ्यांकया विभेदक अभिव्यक्ति विश्लेषण । नाट पूर्व. १–१, १–१० डोइ : १०.१०३८/एनपिरि.२०१०.४२८२.१
एंजेलिस, एमडी, पिकोलो, एम, वान्निनी, एल, सिरागुसा, एस, जियाकोमो, ईस्वी, सेराजानेट्टी, डीआई, एट अल। (२०१३) अटिजम व व्यापक विकासात्मक विकार दुपिं मस्तय् मल माइक्रोबायोटा व मेटाबोलोम मेकथं निर्दिष्ट मजूगु । प्लस वन ८, ई७६९९३। डोइ : १०.१३७१/जर्नल.पोने.००७६९९३
एवेरिना ओभी, कोव्तुन एएस, पोल्याकोभा एसआई, साविलोभा एएम, रेब्रिकोभ डीभी, दानिलेन्को वीएन (2020)। अटिज्म स्पेक्ट्रम विकार दुपिं चीधिपिं मस्तय् गु आन्द्राया माइक्रोबायोटाया ब्याक्टेरियाया न्युरोमेटाबोलिक विशेषता । चिकित्सा सूक्ष्मजीव विज्ञान के जर्नल 69, 558-571. डोइ : १०.१०९९/जेएमएम.०.००११७८
बाकेरो एफ, नोम्बेला के (2012). माइक्रोबायोम मनूया अंगकथं । क्लिनिकल माइक्रोबायोलोजी व संक्रमण 18, 2-4. डोइ : १०.११११/जे.१४६९-०६९१.२०१२.०३९१६.एक्स
बाउर टी, डुरे पी (2023). प्रोपिओनिक एसिड-उत्पादक ब्याक्टेरियाया फिजियोलोजीइ न्हुगु अन्तर्दृष्टि: एनारोटिग्नम प्रोपिओनिकम व एनारोटिग्नम नियोप्रोपिओनिकम (न्हापा क्लोस्ट्रिडियम प्रोपिओनिकम व क्लोस्ट्रिडियम नियोप्रोपिओनिकम)। सूक्ष्मजीव ११, ६८५. डोइ: १०.३३९०/सूक्ष्मजीव ११०३०६८५
बेजर एफडब्ल्यू, स्पेंसर टीई, वु जी, कड टीए, मेनिन्गर एसजे (2004)। मांया पोषण व भ्रूणया विकास । जे पोषक. १३४, २१६९–२१७२. डोइ : १०.१०९३/जेएन/१३४.९.२१६९
बेन्जामिनी, वाई, व होचबर्ग, जे (1995). मखुगु-सकारात्मक दरयात नियन्त्रण यायेगु : बहु परीक्षणया निंतिं छगू व्यावहारिक व दक्ष दृष्टिकोण। जेआर स्ट्याट सोक सेर बी मेथोडोल. ५७, २८९–३००. डोइ : १०.११११/जे.२५१७-६१६१.१९९५.टिबि०२०३१.एक्स